Transformers War For Cybertron nos cuenta la historia de los últimos días de la guerra civil entre Autobots y Decepticons, en la superficie de Cybertron. Mientras que Megatron y su ejército intenta devolver Cyberton a su “época de oro”, los Autobots tratan de defenderla y en el medio se pueden ver hitos como la sucesión de Optimus a Prime, con la destrucción de su líder; la deserción de Starscream a los Decepticons y muchos momentos de los que escuchamos, pero pocas veces vimos en la serie original.
